Labore
Bioinformatik
Lerninhalte
- Daten und Datenwachstum
 - Biologische Grundlagen
 - Datenbanken und Public-Domain-Bioinformatikeinrichtungen
 - Grundlagen des Sequenzvergleichs
 - Methoden des Sequenzalignments
 - Heuristische Methoden zum Sequenzvergleich
 - Multiple Alignments
 - Primer Design
 
Ausstattung
 Hardware:
 je 39 Arbeitsplatzrechner
 1 Windows- Server
 1 Linux-Server
 1 Lizenzserver
 Anbindung aller Rechner an das Campusnetz
 1 Scanner
 1 Farblaserdrucker (DIN A3)
Software:
 MS Office
 Autocad mit verschiedenen Symbolbibliotheken
 Inventor
 Entwicklungsumgebung MS-Visual Studio
 ArcGIS
 Quantum GISChemcad
 MySQL
 FEFLOW-Simulationstool für Grundwassersituationen (Strömungs- und Transportmodelle)
Technische Daten:
 Die Einzelplatzrechner sind als leistungsfähige Rechner für den Einsatz als CAD-Stationen sowie zur Simulation von verfahrenstechnischen Prozessen ausgelegt.
 Alle Rechner sind in einem Labor-Datennetz eingebunden und können auf den Laborserver wie auch das Campusnetz zugreifen.
Praktika und Übungen
 Übungen zu
◾ Datenbanken und Datenbankrecherchen, z. B. GenBank, UniProt, PDB, KEGG, ensembl
◾ Paarweisen Sequenzalignments, z. B. Lalign, Needle, Water
◾ Sequenzvergleichssuche in Datenbanken, z. B. BLAST, FASTA
◾ Multiple Sequenzvergleiche, z. B. Clustal Omega
◾ Primerdesign, z. B. Primer-BLAST
  
 Einsatz des Labors bei Forschungsprojekten
◾ V. a. qPCR Assay Design